Залишаючи приміщення Батуринський Крупицький Свято-Миколаївський жіночий монастир служителі УПЦ покинули доволі промовисті «цінності» – портрети канонізованих РПЦ колишнього царя Миколи ІІ та його дружини. 26 січня 2026 року завершився термін дії договору між Національним історико-культурним заповідником «Гетьманська столиця» та релігійною організацією «Батуринський Крупицький Свято-Миколаївський жіночий монастир Ніжинської єпархії УПЦ» щодо користування культовими спорудами монастиря. У 1996 році монастир разом із прибудовами було включено до складу пам’яток Національного історико-культурного заповідника «Гетьманська столиця». А з 1999 року тут діяв жіночий монастир УПЦ.